Hopp til innhold

Sekvensering av en prøve fra hettemåke avdekket det lengste kjente calicivirusgenomet

Black-headed gull in winter plumage flying over open water
Forskning: Genetikk & genomikk, Sykdom, parasitter & mikrobiologi

En avføringsprøve samlet fra hettemåke (Chroicocephalus ridibundus) i Ungarn i 2018 ga et taksonomisk nytt fuglecalicivirusgenom. Calicivirus er små RNA-virus som finnes hos en rekke virveldyr, også fugler. Genomrapporten, publisert 2. september 2026, beskrev en sekvens på 8 845 nukleotider som forfatterne regner som det lengste kjente calicivirusgenomet. At virusgenomet ble hentet ut viser at genetisk materiale fra viruset fantes i avføringsprøven; studien undersøkte ikke om måka var syk av viruset.

Lange RNA-strukturer gjorde genomet uvanlig

Den uvanlige lengden skyldtes hovedsakelig lange ikke-kodende ender på RNA-genomet. I 5′-enden predikerte forskerne et type IV internt ribosomalt inngangssted, IRES – et strukturert RNA-område som kan bidra til å starte proteinsyntesen gjennom en alternativ translasjonsmekanisme. Calicivirus har vanligvis korte ikke-kodende ender, men flere fuglelinjer har langt lengre 5′-regioner med IRES-strukturer. Det ungarske genomet hadde også et s2m-lignende motiv i den ikke-kodende 3′-enden, en liten bevart RNA-struktur som finnes i flere virusfamilier.

For avvikende for alle anerkjente slekter

Det viktigste kapsidproteinet, VP1, var svært forskjellig fra kjente representanter for de anerkjente calicivirusslektene og hadde mindre enn 26 % aminosyreidentitet med dem. Fylogenetiske analyser plasserte stammen i en genetisk variert linje av fuglecalicivirus som ikke er tilordnet noen godkjent slekt. Forfatterne foreslår at det ungarske viruset og et beslektet calicivirus fra en måke i New Zealand kan representere de første medlemmene av en ny slekt, foreløpig kalt «Birovirus». Dette er et taksonomisk forslag, ikke en formelt godkjent slekt.

Forskerne undersøkte også ti andre avføringsprøver fra måker i Ungarn med målrettet RT-PCR, som her ble brukt til å lete spesifikt etter virusets RNA-sekvens, men ingen var positive for det nye caliciviruset. Studien dokumenterer dermed et komplett og svært avvikende genom fra én hettemåkeprøve, mens det fortsatt er uavklart hvor vanlig denne viruslinjen er blant måker.

Kilder og bildekreditering

  1. Reuter, G., Balázs, B., Mátics, R., Boros, Á., & Pankovics, P. (2026). Novel avian calicivirus genome with type IV internal ribosomal entry site (IRES) in black-headed gull (Chroicocephalus ridibundus) in Hungary.Primary open-access genome report published 2 September 2026. A black-headed gull faecal specimen collected in Hungary in 2018 yielded an 8,845-nucleotide calicivirus genome, the longest known to the authors. It contained a predicted type IV IRES at the 5′ end and an s2m-like motif at the 3′ end; VP1 divergence placed the strain outside all recognized calicivirus genera. Ten additional gull faecal samples were negative by targeted RT-PCR.

Bilde: Hettemåke ved Klydesøen på Amager i Danmark, 4. mars 2018. Foto: Donald Hobern / Wikimedia Commons / Flickr. CC BY 2.0. Representativt artsbilde; ikke måka som ble prøvetatt i Ungarn. · CC BY 2.0 · Kilde

Om innholdet: Denne saken er produsert med KI-assistanse i en redaksjonell arbeidsflyt utviklet av Wildlife Vagabond. Det redaksjonelle ansvaret ligger hos Wildlife Vagabond.Slik brukes KI

Genetikk & genomikk

ARTER I SAKEN

Arten i saken

Hettemåke Chroicocephalus ridibundus Utforsk arten

Uavhengig nyhetsarkiv for forskning og naturvern

Var denne informasjonen nyttig?

Wildlife Vagabond er utviklet og vedlikeholdt uavhengig. Frivillig støtte bidrar til kildekontroll, drift og videre arbeid med forsknings- og naturvernnyheter.

Støtt Wildlife Vagabond

Nyhetsarkivet forblir fritt tilgjengelig.