Hopp til innhold

Første genom for gullsjakal plasserte 98,4 % av sekvensen i kromosomstore sekvensblokker

Golden jackal standing in natural habitat
Forskning · Genetikk & genomikk

Det første genomet for gullsjakal (Canis aureus) plasserer nesten hele sekvensen på 2,53 milliarder basepar i kromosomstore segmenter. Studien, publisert 6. mars 2026, bygger på vev fra en ung hann som ble samlet inn i Villach i Østerrike, og gir en ny referanse for forskning på artens genetikk, spredning og samspill med sykdomsframkallende organismer.

Gullsjakalen var blitt skutt av en jeger i Kärnten i juni 2023. Miltvev fra den påfølgende obduksjonen ble brukt til langlesningssekvensering med PacBio HiFi, som gir lange DNA-sekvenser med høy nøyaktighet.

Nesten hele genomet ble forankret til kromosomer

Den ferdige sammenstillingen har en samlet lengde på 2,53 milliarder basepar fordelt på 325 sekvenssegmenter, eller scaffolds — større blokker av sammensatt DNA-sekvens. De 40 største kunne knyttes til de forventede 38 autosomene samt X- og Y-kromosomet og inneholder til sammen 98,4 % av hele sammenstillingen.

Forfatterne beskriver resultatet som et pseudochromosomalt genom. Det lagrede vevet egnet seg ikke til Hi-C-data, som kan hjelpe med å ordne sekvenser etter hvordan de ligger fysisk i kromosomene. Derfor brukte forskerne genomet til meksikansk ulv som referanse for å ordne sekvensene på kromosomnivå og fylte deretter gjenværende hull med langlesningene fra gullsjakalen. Y-kromosomet ble bare delvis løst: den pseudoautosomale regionen og den hannspesifikke delen lot seg ikke koble til én fullstendig sekvens.

Mer enn 20 000 proteinkodende gener ble identifisert

Den standardiserte annoteringen identifiserte 20 620 proteinkodende gener og 17 626 ikke-kodende gener. Repeterende DNA utgjorde 40,6 % av genomet, med LINE-elementer — lange gjentatte DNA-sekvenser knyttet til mobile genetiske elementer — som den største komponenten. Både mål på genkompletthet og hvor godt sekvensavlesningene lot seg kartlegge tilbake til genomet viste en svært komplett sammenstilling.

Forfatterne beskriver genomet som en referanseressurs, ikke som dokumentasjon på én bestemt biologisk mekanisme. Målet er å gjøre framtidige sammenligninger mellom gullsjakalbestander mer presise, blant annet i studier av spredning, tilpasning, hybridisering og samspill mellom vert og patogener.

Genomet er offentlig tilgjengelig i GenBank med tilgangsnummer GCF_053574225.1 og kan dermed brukes videre i forskning på populasjonsgenetikk, evolusjon og sykdomsøkologi.

Kilder og bildekreditering

  1. Winter, S., Meißner, R., Prost, S., Greve, C., Gerheim, C., Arakelyan, M., Aghayan, S. A., Ghazaryan, A., Hatlauf, J., & Burger, P. A. (2026). A pseudochromosomal reference genome of the golden jackal, Canis aureus. Journal of Heredity, 117(4), 901–907. https://doi.org/10.1093/jhered/esag021Primary research article published online 6 March 2026. The first golden jackal genome assembly spans 2.53 Gb in 325 scaffolds, with 98.41% anchored to the expected 38 autosomes plus X and Y chromosomes; annotation identified 20,620 protein-coding genes. The sample came from a subadult male collected in Villach, Carinthia, Austria, in 2023.

Bilde: Vengolis — gullsjakal (Canis aureus) stående i naturlig vegetasjon, fotografert 22. april 2023; Wikimedia Commons; representativt artsbilde, ikke den østerrikske hannen som ble brukt til genomsekvenseringen · CC BY-SA 4.0 · Kilde

Om innholdet: Denne saken er produsert med KI-assistanse i en redaksjonell arbeidsflyt utviklet av Wildlife Vagabond. Det redaksjonelle ansvaret ligger hos Wildlife Vagabond.Slik brukes KI

Genetikk & genomikk

ARTER I SAKEN

Arten i saken

Gullsjakal Canis aureus Utforsk arten

Uavhengig nyhetsarkiv for forskning og naturvern

Var denne informasjonen nyttig?

Wildlife Vagabond er utviklet og vedlikeholdt uavhengig. Frivillig støtte bidrar til kildekontroll, drift og videre arbeid med forsknings- og naturvernnyheter.

Støtt Wildlife Vagabond

Nyhetsarkivet forblir fritt tilgjengelig.