Nytt picornavirus fra avosett kan representere en ny slekt
Forskere har karakterisert arvematerialet til et tidligere ukjent picornavirus fra en avosett (Recurvirostra avosetta) i Ungarn. Studien ble publisert i Scientific Reports 19. februar 2026 og bygger på en kloakkprøve samlet inn ved Fertősjøen i nasjonalparken Fertő-Hanság i juni 2018.
Prøven ble først analysert i en samleprøve sammen med en prøve fra dvergsnipe (Calidris minuta). Da sekvenseringen avdekket arvemateriale fra picornavirus, gikk forskerne tilbake til de opprinnelige, separate prøvene og testet dem med RT-PCR. Bare prøven fra avosetten var positiv, slik at virussekvensen kunne knyttes til denne fuglen.
Viruset kan representere både en ny art og en ny slekt
Det nesten fullstendige genomet var 7 410 nukleotider langt. Den kodende delen besto av 6 567 nukleotider og kodet for et polyprotein på 2 189 aminosyrer. Flere deler av dette polyproteinet skilte seg sterkt fra kjente virus. P1-regionen, som gir opphav til virusets kapsidproteiner, hadde sitt nærmeste treff i en picornavirussekvens fra japantrane, med 53 % identitet mellom aminosyrene. 2C-helikasen og 3C-proteasen — proteiner som deltar i kopieringen av virusgenomet og bearbeidingen av polyproteinet — hadde bare 52,6 og 52,3 % identitet med sine nærmeste kjente treff, mens 3D-RNA-polymerasen bare nådde 43,2 % identitet med den nærmeste tilsvarende sekvensen fra et picornavirus hos småhegre.
Sekvenssammenligninger og fylogenetiske analyser plasserte viruset i picornavirusunderfamilien Heptrevirinae. Den ikke-kodende 5′-regionen inneholdt en type III-IRES — en strukturert RNA-del som hjelper virusgenomet med å starte produksjonen av proteiner — med et uvanlig domenemønster som også finnes hos flere andre picornavirus fra fugler. Sammen med de store forskjellene i proteinsekvensene og virusets separate plassering i de fylogenetiske trærne gjorde dette at forfatterne konkluderte med at det kan representere både en ny virusart og det første medlemmet i en ny slekt, som de foreslår navnet «Hansagivirus» for etter området der prøven ble samlet inn.
Den ikke-kodende 3′-enden av genomet var også uvanlig. Den inneholdt to gjentatte RNA-motiver: et motiv på 17 nukleotider forekom fem ganger og ble beregnet å kunne danne sin egen sekundærstruktur i RNA-et, mens et annet motiv på ni nukleotider forekom to ganger. Funksjonen til disse gjentatte sekvensene er ukjent.
Studien knyttet ikke viruset til sykdom
Studien viser ikke at viruset forårsaket sykdom hos avosetten. Forfatterne påpeker at mange beslektede picornavirus hos fugler er påvist ved symptomfrie infeksjoner, mens forekomst hos andre fuglearter og evnen til å krysse artsbarrierer fortsatt er ukjent. De mener tilknytningen til vannmiljøer kan være viktig og etterlyser mer forskning på forholdet mellom disse virusene og våtmarker.
Genetikk & genomikk
Lignende nyheter
Tarmmikrobiomene hos ni Kruger-pattedyr grupperte seg tydeligere etter diettype enn art
En studie av 89 kvalitetsfiltrerte avføringsprøver fra ni ville pattedyrarter i Kruger nasjonalpark fant tydelige mikrobiomgrupper hos rovdyr,…
Les saken →
Nesten tre av fire trekkende rødvingetroster hadde flått under to milde belgiske høster
Flått ble funnet på 72,9 % av 284 rødvingetroster på sent høsttrekk i Belgia; 12,9 % av 698…
Les saken →
mFISH koblet 16 av 22 kromosomtyper hos rhesusape til ett enkelt menneskekromosom
Kromosommaling med humane prober viste én-til-én-homologi for 16 av 22 kromosomtyper hos rhesusape, mens tre rhesusapekromosomer kombinerte materiale…
Les saken →ARTER I SAKEN
Arten i saken
Uavhengig nyhetsarkiv for forskning og naturvern
Var denne informasjonen nyttig?
Wildlife Vagabond er utviklet og vedlikeholdt uavhengig. Frivillig støtte bidrar til kildekontroll, drift og videre arbeid med forsknings- og naturvernnyheter.
Støtt Wildlife VagabondNyhetsarkivet forblir fritt tilgjengelig.