Hopp til innhold

16 nye DNA-markører ga genotyper fra hårprøver av ekorn i Sør-Frankrike

Eurasian red squirrel feeding on the ground in Talence, France
Forskning · Genetikk & genomikk

Forskerne utviklet 16 nye mikrosatellittmarkører for ekorn (Sciurus vulgaris) og testet dem med ikke-invasive hårprøver fra fire bestander i Sør-Frankrike. Målet var å utvide det genetiske verktøysettet for bestandsovervåking uten at dyrene må fanges.

Ved hjelp av Illumina-sekvensering og vevsprøver fra sju ekorn undersøkte forskerne 48 mulige mikrosatellittområder og valgte ut 16 markører til videre testing. Disse ble deretter prøvd på hår fra 120 ekorn.

De fleste hårprøvene ga brukbare genotyper

Markørsettet ga brukbare genotyper fra 104 av de 120 hårprøvene, rundt 87 %. Markørene var polymorfe og hadde i gjennomsnitt 6,1 alleler per lokus. De fanget dermed opp genetisk variasjon som kan brukes til å skille individer og sammenligne genetisk mangfold og bestandsstruktur.

Bare én markør viste det samme varselsignalet i alle fire bestandene: tegn til et sannsynlig nullallel. Et nullallel er en genetisk variant som finnes i DNA-et, men som kan bli oversett under genotypingen. Det kan påvirke enkelte populasjonsgenetiske analyser, og forfatterne anbefaler derfor forsiktighet når denne markøren brukes i analyser der slike uoppdagede alleler har betydning.

Markørsettet er utviklet for ikke-invasiv populasjonsgenetikk

Mikrosatellitter er korte, variable DNA-sekvenser som kan brukes med DNA av lavere kvalitet, slik man ofte får fra hårprøver. De 16 nye markørene gir forskerne mer genetisk informasjon når de skal skille individer og sammenligne ekornbestander på det europeiske fastlandet.

Forfatterne utviklet markørsettet fordi bestandsovervåking blir stadig viktigere når ekorn påvirkes av menneskeskapte habitatendringer og, i deler av Europa, av konkurranse og sykdomsrisiko knyttet til introduserte ekornarter.

Kilder og bildekreditering

  1. Isolation and characterization of 16 new microsatellite loci markers for the European red squirrel (Sciurus vulgaris)Open-access peer-reviewed primary study published 14 January 2026. Seven tissue samples were used to screen 48 candidate microsatellite inserts; 16 loci were then evaluated in hair samples from 120 squirrels across four southern French populations, with successful amplification in 104 samples.

Bilde: Hovedbildet viser ekorn. Foto: Murielle Desrois. Kilde: Wikimedia Commons. Representativt bilde for saken; ikke framstilt som et dyr eller en situasjon fra den omtalte studien eller hendelsen. · CC0 1.0 · Kilde

Om innholdet: Denne saken er produsert med KI-assistanse i en redaksjonell arbeidsflyt utviklet av Wildlife Vagabond. Det redaksjonelle ansvaret ligger hos Wildlife Vagabond.Slik brukes KI

Genetikk & genomikk

ARTER I SAKEN

Arten i saken

Ekorn Sciurus vulgaris Utforsk arten

Uavhengig nyhetsarkiv for forskning og naturvern

Var denne informasjonen nyttig?

Wildlife Vagabond er utviklet og vedlikeholdt uavhengig. Frivillig støtte bidrar til kildekontroll, drift og videre arbeid med forsknings- og naturvernnyheter.

Støtt Wildlife Vagabond

Nyhetsarkivet forblir fritt tilgjengelig.