Hopp til innhold

98,6 % av White King-duegenomet ble forankret på kromosomnivå

White King pigeon standing in China
Forskning · Genetikk & genomikk

Et nytt referansegenom på kromosomnivå er satt sammen fra én hunn av White King-duen, en domestisert rase av klippedue (Columba livia) som er mye brukt som kjøttdue i Kina. Studien ble publisert 18. juni 2026 i Scientific Data og kombinerte korte Illumina-sekvenser, lange PacBio HiFi-sekvenser og Hi-C-data, som viser hvilke kromosomområder som kommer i kontakt inne i cellekjernen. White King-individet ble brukt til å bygge det nye referansegenomet; deretter resequensierte forskerne 64 duer fra seks viktige kinesiske markedsraser mot referansen for å kartlegge genetisk variasjon.

98,6 % ble plassert i strukturer på kromosomnivå

Den endelige sammenstillingen var omtrent 1,09 gigabaser (Gb) lang, og 98,6 % av sekvensen ble forankret til 29 strukturer på kromosomnivå. Hi-C hjelper forskerne med å finne ut hvilke sammensatte DNA-fragmenter som hører sammen, og i hvilken rekkefølge og retning de ligger; om lag 1,06 Gb kunne plasseres i en bestemt rekkefølge og orientering. Tallet 29 viser dermed til strukturene på kromosomnivå som ble løst i denne referansesammenstillingen.

Millioner av varianter på tvers av seks raser

Ved hjelp av White King-referansen identifiserte forskerne mer enn 22,68 millioner enkeltbasevarianter (SNP-er) — posisjoner der én DNA-base varierer mellom individer — og omtrent 2,47 millioner små innsettinger og slettinger på tvers av de resequensierte duene. Resultatet ble en stor katalog over genetisk variasjon blant kinesiske kjøttdueraser.

Forfatterne beskriver datasettet som en ressurs for studier av genetisk diversitet og tilpasning hos domestiserte duer. De påpeker også at slike variantdata kan bidra til å rekonstruere bestands- og domestiseringshistorie, og dermed gi et bedre grunnlag for å undersøke hvordan langvarig kunstig seleksjon har formet mangfoldet mellom dueraser.

Kilder og bildekreditering

  1. Yang, G., Zeng, T., Lu, L., Xu, W., Wu, C., Li, H., Tian, Y., Gu, T., Chen, L., Zong, Y., Chang, Y., & Dong, L. (2026). High-Quality Genome Assembly of the White King Pigeon for Genetic Reference of Chinese Market Pigeon Breeds. Scientific Data. https://doi.org/10.1038/s41597-026-07220-4Primary open-access data descriptor published 18 June 2026. A 1.09-Gb White King pigeon assembly placed 98.59% of the genome on 29 chromosomes; 64 pigeons from six Chinese market breeds were also analysed for genomic variation.
  2. National Center for Biotechnology Information. (2024). Columba livia breed White King pigeon BioProject PRJNA1122952.Supporting repository record for the White King pigeon sequencing project.

Bilde: Dinkun Chen / Wikimedia Commons — White King-due fotografert i Kina 6. mai 2026; representativt bilde fra studielandet · CC BY-SA 4.0 · Kilde

Om innholdet: Denne saken er produsert med KI-assistanse i en redaksjonell arbeidsflyt utviklet av Wildlife Vagabond. Det redaksjonelle ansvaret ligger hos Wildlife Vagabond.Slik brukes KI

Genetikk & genomikk

ARTER I SAKEN

Arten i saken

Klippedue Columba livia Utforsk arten

Uavhengig nyhetsarkiv for forskning og naturvern

Var denne informasjonen nyttig?

Wildlife Vagabond er utviklet og vedlikeholdt uavhengig. Frivillig støtte bidrar til kildekontroll, drift og videre arbeid med forsknings- og naturvernnyheter.

Støtt Wildlife Vagabond

Nyhetsarkivet forblir fritt tilgjengelig.