G17 og G6 dominerte enterovirus G hos både japanske villsvin og tamgris

En studie av villsvin (Sus scrofa) og tamgris i Japan fant at to genotyper av enterovirus G, G17 og G6, hadde blitt dominerende hos begge vertene. Forskerne fant samtidig en blanding av viruslinjer: noen var nært beslektet mellom villsvin og tamgris, mens andre så ut til å ha utviklet seg mer selvstendig i villsvinbestandene.
Enterovirus G er et pikornavirus hos svinedyr og inngår i tarmens virusmiljø hos både tamgris og villsvin. Ved å sammenligne genotypene hos de to vertene kan forskerne se hvor viruslinjer deles på tvers av grenseflaten mellom husdyr og vilt, og hvor de ser ut til å utvikle seg mer uavhengig.
Studien analyserte avføringsprøver fra 300 villsvin samlet inn mellom 2018 og 2023 og 363 tamgriser undersøkt mellom 2017 og 2022. Forskerne kombinerte metatranskriptomisk sekvensering — sekvensering av RNA i avføringsprøvene slik at mange virus kunne påvises uten at man på forhånd bare lette etter ett bestemt virus — med virusisolasjon. De konsentrerte seg om pikornavirus og beslektede tarmvirus. Enterovirus G var viruset som oftest ble påvist hos villsvin.
G17 og G6 dominerte hos begge vertene
Blant 73 enterovirus G-stammer kom 25 fra villsvin og 48 fra tamgris. Villsvinstammene fordelte seg på fire genotyper (G1, G6, G8 og G17), mens grisestammene fordelte seg på åtte (G1, G2, G4, G6, G8, G17, G18 og G27). Til tross for det bredere genotypemangfoldet hos tamgris dominerte G17 og G6 hos begge vertene, en parallell økning som forfatterne tolker som tegn på mulig virusutveksling eller felles smittedynamikk. Rekombinasjonsanalyser påviste også genetisk utveksling som involverte enterovirus G-stammer fra villsvin og tamgris. Åtte av 13 G17-stammer isolert fra villsvin i 2023 manglet den papainlignende cysteinproteasen, PL-CP, som hadde vært til stede i alle tidligere rapporterte G17-stammer. PL-CP er en innsatt proteasesekvens i enkelte enterovirus G-genomer, og forekomsten av G17-virus uten denne sekvensen peker mot pågående evolusjonære endringer i villsvinbestandene.
Noen viruslinjer var felles, andre utviklet seg separat
Den bredere virusundersøkelsen viste den samme kombinasjonen av felles og selvstendige evolusjonsmønstre. Totalt ble 67 svineteschovirus-stammer påvist. Alle tre isolatene fra villsvin tilhørte genotype A5, mens isolatene fra tamgris fordelte seg på 11 serotyper, altså et langt bredere typemangfold hos tamgris. Én A5-stamme fra villsvin var nært beslektet med japanske stammer fra tamgris og viste tegn på rekombinasjon med grisvirus, mens de to andre villsvinstammene var genetisk tydelig forskjellige fra kjente japanske grisestammer. Studien identifiserte også 126 svinesapelovirus-stammer, der genetiske grupper hang sammen med fangstområder hos villsvin og gårdsregioner hos tamgris, med en rekke rekombinasjonshendelser. Svinets kobuvirus ble påvist hos japanske villsvin for første gang. En sapovirusstamme fra ett villsvin dannet dessuten en egen utviklingslinje som oppfylte det genetiske kriteriet for en ny genotype og hadde tegn som var forenlige med tidligere rekombinasjon eller smitte mellom regioner. Forskerne konkluderer med at tarmvirus diversifiseres hos både villsvin og tamgris gjennom en kombinasjon av smitte mellom vertene, mutasjoner og homolog rekombinasjon — genetisk utveksling der beslektede virus bytter tilsvarende deler av arvematerialet — samtidig som enkelte viruslinjer ser ut til å utvikle seg selvstendig i villsvinbestandene.
ARTER I SAKEN
Arten i saken
Uavhengig nyhetsarkiv for forskning og naturvern
Var denne informasjonen nyttig?
Wildlife Vagabond er utviklet og vedlikeholdt uavhengig. Frivillig støtte bidrar til kildekontroll, drift og videre arbeid med forsknings- og naturvernnyheter.
Støtt Wildlife VagabondNyhetsarkivet forblir fritt tilgjengelig.



