Hopp til innhold

Jordsvin har fått et nytt referansegenom på kromosomnivå

Aardvark standing in the entrance of a burrow
Forskning · Genetikk & genomikk

Et nytt referansegenom for jordsvin (Orycteropus afer) på kromosomnivå ble publisert gjennom Vertebrate Genomes Project i januar 2026. Ressursen inneholder to haplotypeoppløste genomsekvenser fra det samme hannindividet og er langt mer sammenhengende enn eldre jordsvingenomer. Haplotypeoppløst betyr her at de to kromosomsettene ble satt sammen hver for seg i stedet for å bli slått sammen til én konsensussekvens, slik at forskjeller mellom dem bevares.

Prøven kom fra et hannindivid i Bronx Zoo og ble koordinert av Wildlife Conservation Society, mens sekvenseringen ble utført ved Vertebrate Genome Laboratory ved Rockefeller University. Prosjektet kombinerte lange, svært nøyaktige DNA-avlesninger med Hi-C-data, som brukes til å plassere sekvensbiter på riktig sted i kromosomene.

De to haplotypeassembliene omfatter rundt 4,71 og 4,29 milliarder basepar og ble frigitt på kromosomnivå 23. januar 2026. Eldre jordsvingenomer var fortsatt delt opp i store sekvensbiter, eller scaffolder, i stedet for å være satt sammen på kromosomnivå. Det nye referansegenomet gir derfor et langt mer sammenhengende grunnlag for å studere hvordan jordsvingenomet er organisert og sammenligne det med andre pattedyr. Det er særlig nyttig for en art som er den eneste nålevende representanten for ordenen Tubulidentata.

Kilder og bildekreditering

  1. National Center for Biotechnology Information. (2026). Orycteropus afer (aardvark) genome, mOryAfe1 [BioProject PRJNA1413393].Primary public genome project registered 23 January 2026. The sample came from a male aardvark at the Bronx Zoo and was coordinated by the Wildlife Conservation Society for a high-quality Vertebrate Genomes Project reference genome.
  2. Vertebrate Genomes Project / GenArk. (2026). Orycteropus afer — mOryAfe1.hap1, GCA_054668785.1.Chromosome-level haplotype 1 released 23 January 2026; total length 4.714 Gb and scaffold N50 655.4 Mb.
  3. Vertebrate Genomes Project / GenArk. (2026). Orycteropus afer — mOryAfe1.hap2, GCA_054668755.1.Chromosome-level haplotype 2 released 23 January 2026; total length 4.293 Gb and scaffold N50 643.8 Mb.

Bilde: Louise Joubert / Wikimedia Commons — jordsvin i åpningen av et hi ved SanWild Wildlife Sanctuary i Sør-Afrika; representativt artsbilde, ikke hannen som ble brukt til referansegenomet i 2026 · CC BY-SA 3.0 — https://creativecommons.org/licenses/by-sa/3.0/ · Kilde

Om innholdet: Denne saken er produsert med KI-assistanse i en redaksjonell arbeidsflyt utviklet av Wildlife Vagabond. Det redaksjonelle ansvaret ligger hos Wildlife Vagabond.Slik brukes KI

Genetikk & genomikk

ARTER I SAKEN

Arten i saken

Jordsvin Orycteropus afer Utforsk arten

Uavhengig nyhetsarkiv for forskning og naturvern

Var denne informasjonen nyttig?

Wildlife Vagabond er utviklet og vedlikeholdt uavhengig. Frivillig støtte bidrar til kildekontroll, drift og videre arbeid med forsknings- og naturvernnyheter.

Støtt Wildlife Vagabond

Nyhetsarkivet forblir fritt tilgjengelig.