NK-celler hos rhesusaper delte et felles aktiveringsmønster på tvers av akutte virusinfeksjoner
En studie publisert i AIDS Research and Human Retroviruses kartla endringer i naturlige drepeceller, eller NK-celler, hos rhesusaper (Macaca mulatta) under akutt virusinfeksjon. NK-celler er en del av det medfødte immunforsvaret og kan reagere raskt på virusinfiserte celler. Forskerne undersøkte transkriptomet — mønsteret av gener som aktivt leses av til RNA — fordi endringer i genuttrykket viser hvilke signal- og stoffskifteprogrammer cellene slår av og på under infeksjon.
Studien analyserte NK-celler fra to modeller med simian immunsviktvirus (SIV): seks rhesusaper infisert med SIVmac239 og fem med SIVmac251. SIV er et lentivirus i slekt med HIV og brukes mye til å modellere sentrale sider ved HIV-infeksjon hos rhesusaper. I disse forsøkene ble NK-cellene fysisk sortert ut fra blodet, før RNA fra hele den isolerte cellegruppen ble analysert samlet. Dermed fikk forskerne et gjennomsnittlig genuttrykksmønster for NK-cellene på ulike tidspunkt fra akutt infeksjon og inn i tidlig kronisk fase.
Forskerne analyserte deretter publiserte enkeltcelledata fra seks rhesusaper som var eksponert for SARS-CoV-2. Der identifiserte de NK-celler blant immunceller hentet med bronkoalveolær skylling — væske som skylles inn og ut av de nedre luftveiene — og sammenlignet genuttrykksresponsen med SIV-resultatene.
Gener som reagerer på cytokiner endret seg samlet under SIV-infeksjon
Forskerne brukte samlede gensett bygget opp av gener som normalt skrus opp eller ned når NK-celler stimuleres av cytokinene IL-2 og IL-15. Cytokiner er signalproteiner som får immunceller til å aktiveres, overleve eller endre funksjon; gensettene ga derfor et mål på hvor sterkt NK-cellene hos de infiserte apene lignet en cytokinaktivert tilstand. Under SIV-infeksjonen endret flere stoffskifte- og signalprogrammer seg i takt, ikke bare enkeltgener hver for seg.
Noen av genuttrykksendringene samsvarte med mønstre som tidligere er knyttet til svekket NK-cellefunksjon under lentivirusinfeksjon. Studien målte RNA-uttrykk og testet ikke drepeevnen til hver celle direkte, slik at mønsteret støtter en tolkning knyttet til dysfunksjon, men ikke er en funksjonstest i seg selv.
27 gener økte under akutt infeksjon i alle tre datasettene
Da forskerne sammenlignet de to SIV-kohortene med SARS-CoV-2-datasettet, fant de 27 gener som var oppregulert under akutt infeksjon i alle tre. Bredere analyser av genprogrammer viste også et bevart kjernepreg for NK-celleaktivering på tvers av virusinfeksjonene. Et felles transkripsjonelt fingeravtrykk betyr dermed at en del av genuttrykksresponsen gjentok seg mellom infeksjonene; det betyr ikke at SIV og SARS-CoV-2 gir samme sykdom eller påvirker alle NK-cellefunksjoner likt.
Forfatterne beskriver dette bevarte mønsteret som et rammeverk for å studere hvordan signalering og stoffskifte i NK-celler reagerer på akutt virusinfeksjon hos rhesusaper. Sammenligningen viser ikke i seg selv at det samme 27-genmønsteret har den samme betydningen hos mennesker.
Molekylærbiologi & biokjemi
Lignende nyheter
DNA-metyleringen endret seg da namibiske hanngeparder ble territorielle
Parvise blodprøver fra ti frittlevende namibiske hanngeparder viste omfattende, hovedsakelig økt DNA-metylering etter at de samme individene ble…
Les saken →
Svalbardrype og gullhamster delte en TSH-signalvei for sesongstyring
En sammenligning av hjerne- og hypofysevev i sommer- og vintertilstand fant den samme sentrale TSH-signalveien for sesongstyring hos…
Les saken →
Større kull og eldre sosiale fedre hang sammen med kortere telomerer hos hannunger av låvesvale
En langtidsstudie nær Milano fant kortere telomerer hos hannunger av låvesvale fra større kull eller med eldre sosiale…
Les saken →ARTER I SAKEN
Arten i saken
Uavhengig nyhetsarkiv for forskning og naturvern
Var denne informasjonen nyttig?
Wildlife Vagabond er utviklet og vedlikeholdt uavhengig. Frivillig støtte bidrar til kildekontroll, drift og videre arbeid med forsknings- og naturvernnyheter.
Støtt Wildlife VagabondNyhetsarkivet forblir fritt tilgjengelig.